阴茎短小出现在自己身上时，多数男性不知道去寻找原因所在，只会盲目吃些激素类药物。这种做法有时只会造成适得其反的效果。解决阴茎短小问题，需要先搞清楚导致阴茎短小的原因有哪些。
睾丸酮不足：睾丸酮是很重要的雄性激素，如果在青春发育期睾丸有问题，无法生产睾丸酮（雄性激素），就可导致阴茎不发育或发育不全等。到了成年期后，男性发育结束，阴茎要比常人短小。
先天性小睾丸症：这种病症也会引起睾丸分泌男性激素不足，患者缺乏性欲和正常性功能。虽然可以使用睾丸酮来治疗，但只能增强性功能，不能恢复生育。
促性腺激素缺乏：促性腺激素性腺机能低下病是下丘脑或脑腺体病变引起，睾丸功能虽然正常，但接受不到来自下丘脑或脑腺体促性腺激素的指令，睾丸酮分泌同样不足。
肥胖：一些小腹部、耻骨联合部、会阴部脂肪丰满突出的男性，阴茎的发育往往比起正常男性的阴茎会相对短小。
遗传因素：阴茎与身体其它器官一样，其大小及形态特点要受遗传基因的控制与影响。
其它方面：如内分泌紊乱，阴睾或阴囊肿胀产生的阴茎“回缩”等，都是导致阴茎短小的原因。
阴茎短小对于男性的性生活、男性健康的影响都很大。要想重新恢复幸福的夫妻生活，需要规范化的分析疾病的情况，找到原因，然后对症治疗。
